1960年成立中国农工民主党徐医支部。
1990年6月成立中国农工民主党徐医总支委员会；1994年7月农工徐医总支委员会召开第二次全体党员大会，选举产生了第二届总支委员会；1999年9月农工徐医总支委员会召开第三次全体党员大会，选举产生了第三届总支委员会；2003年1月农工徐医总支委员会召开第四次全体党员大会，选举产生了第四届总支委员会；2010年12月农工徐医总支委员会召开第五次全体党员大会，选举产生了第五届总支委员会；2016年4月召开中国农工民主党徐州医科大学委员会成立大会，同时选举产生了第一届中国农工民主党徐州医科大学委员会。
在上级农工党组织和学校党委的领导下，在校党委统战部的大力支持下，农工徐医委员会带领全体党员，切实加强自身建设，立足本职工作，积极开展有意义的社会活动，服务于社会，服务于人民。始终把参政议政、民主监督作为重要的职能，从多层次、 多方位、多途径，认真履行职责，努力为社会、学校、医院的改革和事业发展做出贡献，多次获省、市农工党先进基层组织称号。
委员会党员中现有省、市、区三级政协委员9名，委员们围绕学院的中心工作，特别关注医学教育和医药卫生事业的改革和发展，以及人民群众所关心的社会热点，深入调查研究论证，近年来共撰写有建树的提案近100项，受到政府及各相关部门的重视和采纳。
